惠民藥局始源于北宋熙寧九年在京城開封設置的太醫局熟藥所，又稱修和賣藥所，委派官員監制和銷售成品藥，是官辦藥局的創始。

        政和四年熟藥所改稱醫藥惠民局，金朝時亦仿照宋朝制度設立惠民局。

        至元代，惠民藥局受太醫院督管，體制更加完備，設立規模也隨之擴大。

        惠民藥局自宋金元三代以來，其制度得到了很大的發展和完善，其設立區域和規模也擴大了，對解決和保障貧民的醫藥問題起了一定的作用。

        朱元璋建立明朝之后，沿襲前代制度，設立惠民藥局。

        救濟貧困病患、預防瘟疫蔓延頗為古代的統治者所重視，所以創立之后就被一直延續。

        北宋時期，王安石變法，按照當時新法中“市易法”的規定，藥品的貿易必須由政府控制，經營藥品是國家專利，不允許任何人私自制作或經營任何藥品。

        北宋時期的藥局賣藥的同時，還配有醫官，為病人診斷并提供處方，看醫用藥十分便利，頗受百姓歡迎。

        到了南宋時期，統治者偏安東南，軍事實力較弱，但社會經濟仍然很發達，依舊重視惠民藥局的建立。

        而每逢疫情肆虐，朝廷就會令惠民藥局派出醫官攜帶藥品，走街串巷，上門診治，給散湯藥，以免疫情蔓延。

        在瘟疫暴發期間，惠民藥局實行通宵服務，日夜都有專職人員值班，要是“夜民間緩急贖藥，不即出賣”，按“從杖一百科罪”。

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